Die Grundschule Affing war Teil des Schulversuchs „Flexible Grundschule“. Dieses Projekt, eine Kooperation des Bayerischen Staatsministeriums für Unterricht und Kultus mit der Stiftung Bildungspakt Bayern, begann im Schuljahr 2010/2011 und war ursprünglich auf drei Jahre angelegt. Von Anfang an nahmen 20 sogenannte „Stammschulen“ an diesem Modellversuch teil.
Bis zum Schuljahr 2013/2014 wurde das Modell auf weitere 69 Schulen, die sogenannten „Satellitenschulen“, ausgeweitet, sodass in jedem Schulamtsbezirk eine Flexible Grundschule zur Verfügung stand. Ein Kernziel des Schulversuchs war es, didaktische Konzepte zur individuellen Förderung der Schüler zu entwickeln und in der Praxis zu erproben.